Система апнеа-йога формировалась в качестве практического метода тренировки тела и сознания для профессионалов-фридайверов. Импульсом к созданию тренировочных программ стала идея найти наиболее "рабочие" техники йоги и на основе их разработать эффективные программы для подготовки спортсменов-фридайверов на суше. Занятия фридайвингом близки практике йоги в аспектах необходимости развития совершенного контроля над телом, дыханием и сознанием человека.
Главная цель практики в апнеа-йоге – дыхание. Процесс дыхания в организме человека, обладает двумя важнейшими особенностями: он автономный и одновременно управляем сознанием человека.
Изменение дыхания ощущается человеком гораздо быстрее, чем любой другой процесс. Получив контроль над этим процессом, человек в состоянии изменить все жизненные процессы, происходящие в организме.
Как утверждают последователи апнеа-йоги, постоянные практики избавляют от бесконечной суеты в голове и прибавляют бодрости и сил организму.